No dia 15 de dezembro, quando o clube catalão disputava o Mundial de Clubes da Fifa, no Japão, Villa, em partida contra o Al-Sadd, do Catar, machucou-se sozinho ao pisar errado e teve que ser substituído. Exames posteriores diagnosticaram a fratura na tíbia da perna esquerda. Desde então, Villa vem se recuperando e até tinha chances de integrar a equipe comandada pelo técnico Vicente Del Bosque.
“Eu tentei, mas não consegui estar 100% para jogar a Eurocopa. Eu chamei o Vicente Del Bosque para falar isso para ele. É a coisa mais honesta que eu posso fazer; Obrigado a todos pelo apoio. Eu vou continuar trabalhando para voltar a jogar pelo Barcelona e pela Espanha o mais rápido possível”, escreveu Villa em seu perfil oficial no Twitter.