Da quantia informada, 50% irá para o Bahia e os outros 50% irão para o Palmeiras, que ainda tinha uma parte dos direitos econômicos do atleta. O defensor era titular absoluto da equipe de Dado Cavalcanti nesta temporada, tendo disputado 20 jogos e marcado dois gols. No Verdão, Juninho disputou 25 jogos entre 2017 e 2018.
Juninho também já teve passagens por Coritiba, onde despontou no futebol brasileiro, e Atlético-MG. O FC Midtjylland também contratou recentemente o volante Charles, do Ceará.