O primeiro "sumiço" de Fernandinho veio no Bugre. Alegando problemas pessoais, o jogador pediu sua rescisão de contrato após a 14ª rodada do Brasileiro. Antes, já havia faltado a dois treinamentos. Meses depois, o jogador reclamou de salários atrasados. Na ocasião, o atacante havia disputado 12 partidas pelo Brasileiro, sendo oito como titular, mas sem marcar gols.
Já no ano passado, foi a vez de se envolver em polêmica no Remo, também durante a Série C. Antes de uma partida contra o América-RN, pela nona rodada, o jogador, sem autorização da diretoria, viajou para São Paulo e assim não embarcou com o restante da delegação para Natal. Mais uma vez, o atleta alegou problemas pessoais. Após receber um ultimato da direção paraense, o jogador se reapresentou e acabou reintegrado. Ao todo, disputou 11 jogos (dez como titular) e marcou apenas um gol.
O último clube de Fernandinho foi o Botafogo-PB, onde disputou toda a atual temporada. Após ser campeão estadual, tendo atuando em 12 partidas, sendo oito como titular, e balançado as redes três vezes, o avançado acabou perdendo espaço na Série C, onde acabou na reserva de Dico, que acabaria contratado pelo Náutico para a reta final da Série B e não teve o seu contrato renovado. Foram 11 partida ao todo, apenas uma como titular, sem novamente balançar as redes.